Ekim 1925’de Trabzon Maçka ilçesinde Konak Mahallesi’nde doğdu. Ailesi Ocaklı (İspela) Köyündendir. İlkokulu Maçka’da (1938), orta okulu İstanbul’da (Gaziosmanpaşa, Zeyrek ve Yenikapı ortaokullarında) okudu (1944). Ortaokul yıllarında nakşibendi tarikatına girdiği için ortaokulu ancak altı yılda bitirebildi. Liseye Pertevniyal’de başladı, Vefâ Lisesi’nde bitirdi. (1947-48)

1958’de Trabzon’a gitti. Maçka Ortaokulu’nda Türkçe ve Tarih öğretmenliği yaptı, 1959 sonuna kadar burada kaldı. Buradan tekrar İstanbul’a döndü ve bu tarihten sonra resmi bir görev almayarak, çalışmalarını Anadolu uygarlığı, Halk Bilgisi, Folklor, Türk Dili konularında yoğunlaştırdı, bağımsız yazar olarak kalemiyle geçindi. İsmet Zeki’nin ilk yazısı, 1946’da Emin Oktay’ın çıkardığı Tarihten Sesler dergisinde çıktı. Yazarlığının ilk ürünleri Türk Araştırmaları Dergisi’nde Karadeniz folkloru denemeleridir. (1948- 1958) Almanca, Latince, Arapça, Farsça gibi dillerden çeviriler yaptı, çeşitli yayın organlarında araştırma ve incelemeleri yayımlandı. Yeşilay, Türk Folklor Araştırmaları, Hamsi, Edebiyat Alemi, Türk Dili, Varlık, Saçak, Oluşum, Yeni Ufuklar, Kıyı, Yansıma, Yazko Edebiyat, Yeni İnsan... gibi dergilerle, Dünya, Cumhuriyet, Ulus, Yeni Tanin, Yeni Ortam, Aydınlık gibi gazetelerde yazdı. İsmet Zeki Eyüboğlu’nun yazdığı ve çevirdiği kitapların bütün baskılarının sayısı 125’i geçmiştir. 2003 yılında geçirdiği felçten sonra bile, ömrünün son günlerine kadar yazmayı sürdürdü İsmet Zeki Eyüboğlu, 12 Kasım 2003 tarihinde saat 10.00’da vefat etti.Üsküdar, Selimiye Camii’nde 13 Kasım 2003 tarihinde cenaze namazı kılındıktan sonra, memleketi Maçka’ya götürüldü, köyünde 14 Kasım günü toprağa verildi.